结构生物学工具¶
配置文件: packages/structural_biology_tools.json 工具类型: 本地 工具数量: 12
本页面包含在``structural_biology_tools.json``配置文件中定义的所有工具。
可用工具¶
**get_ase_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于ASE（原子模拟环境）的全面信息——一个用于构建、…
get_ase_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_ase_info类型:
PackageTool描述：获取有关 ASE（原子模拟环境）的全面信息——一个用于构建、运行和分析原子级模拟的工具包。
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_ase_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_biopandas_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 BioPandas 的全面信息 —— 基于 pandas 的分子结构分析
get_biopandas_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_biopandas_info类型:
PackageTool描述：获取关于 BioPandas 的全面信息——基于 pandas 的分子结构分析
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_biopandas_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_descriptastorus_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 Descriptastorus 的全面信息——分子描述符计算
get_descriptastorus_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_descriptastorus_info类型:
PackageTool描述：获取有关 Descriptastorus 的全面信息——分子描述符计算
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的关于 Descriptastorus 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_descriptastorus_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_diffdock_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于DiffDock——用于分子对接的扩散模型的全面信息
get_diffdock_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_diffdock_info类型:
PackageTool描述：获取关于DiffDock——用于分子对接的扩散模型的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的关于 DiffDock 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_diffdock_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_freesasa_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关freesasa软件包的信息。计算蛋白质的溶剂可接触表面积。
get_freesasa_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_freesasa_info类型:
PackageTool描述：获取有关freesasa软件包的信息。计算蛋白质的溶剂可及表面积
参数：
无需参数。
示例用法：
query = {
"name": "get_freesasa_info",
"arguments": {
}
}
result = tu.run(query)
**get_htmd_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 htmd 软件包的信息。高通量分子动力学平台
get_htmd_info 工具规范
工具信息：
名称：
get_htmd_info类型:
PackageTool描述：获取有关 htmd 软件包的信息。高通量分子动力学平台
参数：
无需参数。
示例用法：
query = {
"name": "get_htmd_info",
"arguments": {
}
}
result = tu.run(query)
**get_mdanalysis_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 MDAnalysis —— 分子动力学轨迹分析的全面信息
get_mdanalysis_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_mdanalysis_info类型:
PackageTool描述：获取关于MDAnalysis——分子动力学轨迹分析的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的有关 MDAnalysis 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_mdanalysis_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_mdtraj_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 mdtraj 软件包的信息。用于分子动力学轨迹分析的现代库。
get_mdtraj_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_mdtraj_info类型:
PackageTool描述：获取有关 mdtraj 软件包的信息。用于分子动力学轨迹分析的现代库。
参数：
无需参数。
示例用法：
query = {
"name": "get_mdtraj_info",
"arguments": {
}
}
result = tu.run(query)
**get_nglview_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 nglview 软件包的信息。用于分子可视化的 Jupyter 小部件
get_nglview_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_nglview_info类型:
PackageTool描述：获取有关 nglview 包的信息。用于分子可视化的 Jupyter 小部件。
参数：
无需参数。
示例用法：
query = {
"name": "get_nglview_info",
"arguments": {
}
}
result = tu.run(query)
**get_openmm_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 OpenMM —— 分子动力学模拟工具包的全面信息
get_openmm_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_openmm_info类型:
PackageTool描述：获取关于 OpenMM —— 分子动力学模拟工具包的全面信息
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_openmm_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_pyrosetta_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 pyrosetta 软件包的信息。Rosetta 大分子建模的 Python 接口…
get_pyrosetta_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_pyrosetta_info类型:
PackageTool描述：获取有关 pyrosetta 软件包的信息。Rosetta 大分子建模套件的 Python 接口。
参数：
无需参数。
示例用法：
query = {
"name": "get_pyrosetta_info",
"arguments": {
}
}
result = tu.run(query)
**get_pyscf_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 PySCF —— 一个多功能 Python 量子化学框架的全面信息。
get_pyscf_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_pyscf_info类型:
PackageTool描述：获取关于 PySCF 的全面信息——一个功能强大的 Python 量子化学框架。
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_pyscf_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)