单细胞工具¶
配置文件: packages/single_cell_tools.json 工具类型: 本地 工具数量: 14
本页面包含在``single_cell_tools.json``配置文件中定义的所有工具。
可用工具¶
**get_anndata_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 AnnData 的全面信息——用于计算生物学的注释数据
get_anndata_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_anndata_info类型:
PackageTool描述：获取关于 AnnData 的全面信息——用于计算生物学的注释数据
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_anndata_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_cellrank_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 cellrank 软件包的信息。用于单细胞数据中的轨迹推断和细胞命运映射。
get_cellrank_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_cellrank_info类型:
PackageTool描述：获取有关 cellrank 软件包的信息。单细胞数据中的轨迹推断和细胞命运映射
参数：
无需参数。
示例用法：
query = {
"name": "get_cellrank_info",
"arguments": {
}
}
result = tu.run(query)
**get_episcanpy_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 episcanpy 软件包的信息。Python 中的表观基因组单细胞分析
get_episcanpy_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_episcanpy_info类型:
PackageTool描述：获取有关 episcanpy 包的信息。Python 中的表观基因组学单细胞分析
参数：
无需参数。
示例用法：
query = {
"name": "get_episcanpy_info",
"arguments": {
}
}
result = tu.run(query)
**get_mudata_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于MuData的全面信息——用于计算生物学的多模态注释数据
get_mudata_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_mudata_info类型:
PackageTool描述：获取关于MuData——用于计算生物学的多模态注释数据的全面信息
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_mudata_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_palantir_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 palantir 软件包的信息。用于建模连续细胞状态转变的算法
get_palantir_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_palantir_info类型:
PackageTool描述：获取有关 palantir 软件包的信息。用于建模连续细胞状态转换的算法
参数：
无需参数。
示例用法：
query = {
"name": "get_palantir_info",
"arguments": {
}
}
result = tu.run(query)
**get_pyscenic_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 pySCENIC 的全面信息 – 单细胞调控网络推断
get_pyscenic_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_pyscenic_info类型:
PackageTool描述：获取关于 pySCENIC 的全面信息——单细胞调控网络推断
参数：
``info_type``（字符串）（必填）关于 pySCENIC 要检索的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_pyscenic_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_scanorama_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关scanorama软件包的信息。用于单细胞数据的批次校正和整合
get_scanorama_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_scanorama_info类型:
PackageTool描述：获取有关scanorama软件包的信息。用于单细胞数据的批次校正和整合
参数：
无需参数。
示例用法：
query = {
"name": "get_scanorama_info",
"arguments": {
}
}
result = tu.run(query)
**get_scanpy_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关Scanpy的全面信息——基于Python的可扩展单细胞分析
get_scanpy_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_scanpy_info类型:
PackageTool描述：获取关于 Scanpy —— Python 中可扩展的单细胞分析的全面信息
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_scanpy_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_scrublet_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 Scrublet —— 单细胞双重体检测的全面信息
get_scrublet_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_scrublet_info类型:
PackageTool描述：获取关于 Scrublet —— 单细胞双重体检测的全面信息
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_scrublet_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_scvelo_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 scVelo —— 单细胞 RNA 速度分析的全面信息
get_scvelo_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_scvelo_info类型:
PackageTool描述：获取关于 scVelo —— 单细胞 RNA 速度分析的全面信息
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_scvelo_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_scvi_tools_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 scvi-tools 软件包的信息。单细胞组学数据的深度概率分析
get_scvi_tools_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_scvi_tools_info类型:
PackageTool描述：获取有关 scvi-tools 软件包的信息。单细胞组学数据的深度概率分析
参数：
无需参数。
示例用法：
query = {
"name": "get_scvi_tools_info",
"arguments": {
}
}
result = tu.run(query)
**get_souporcell_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 souporcell – scRNA-seq 基因型聚类的全面信息
get_souporcell_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_souporcell_info类型:
PackageTool描述：获取关于 souporcell – scRNA-seq 基因型聚类的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的关于 souporcell 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_souporcell_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_tiledbsoma_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 TileDB-SOMA —— 基于 TileDB 的单细胞数据存储的全面信息
get_tiledbsoma_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_tiledbsoma_info类型:
PackageTool描述：获取有关 TileDB-SOMA 的全面信息——基于 TileDB 的单细胞数据存储方案
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的有关 TileDB-SOMA 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_tiledbsoma_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_velocyto_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 velocyto 软件包的信息。用于单细胞 RNA 测序数据的 RNA 速度分析
get_velocyto_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_velocyto_info类型:
PackageTool描述：获取关于velocyto软件包的信息。用于单细胞RNA测序数据的RNA速度分析。
参数：
无需参数。
示例用法：
query = {
"name": "get_velocyto_info",
"arguments": {
}
}
result = tu.run(query)