生物信息学核心工具¶
配置文件：packages/bioinformatics_core_tools.json
工具类型：本地
工具数量：37
本页面包含 bioinformatics_core_tools.json 配置文件中定义的所有工具。
可用工具¶
**get_arxiv_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 arxiv 的全面信息 – 访问 arXiv 预印本库
get_arxiv_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_arxiv_info类型：
PackageTool描述：获取关于arxiv的全面信息——访问arXiv预印本存储库
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_arxiv_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_biopython_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于Biopython的全面信息——强大的计算分子生物学工具…
get_biopython_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_biopython_info类型：
PackageTool描述：获取关于 Biopython 的全面信息——专为计算分子生物学和生物信息学设计的强大工具
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_biopython_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_bioservices_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 bioservices 软件包的信息。Python 软件包：bioservices
get_bioservices_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_bioservices_info类型：
PackageTool描述：获取有关 bioservices 软件包的信息。Python 软件包：bioservices
参数：
无需参数。
示例用法：
query = {
"name": "get_bioservices_info",
"arguments": {
}
}
result = tu.run(query)
**get_biotite_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于Biotite的全面信息——一款功能齐全的计算分子生物学库
get_biotite_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_biotite_info类型：
PackageTool描述：获取有关Biotite的全面信息——一款功能全面的计算分子生物学库
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_biotite_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_cryosparc_tools_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 cryosparc-tools 的全面信息 —— CryoSPARC 冷冻电镜处理的接口
get_cryosparc_tools_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_cryosparc_tools_info类型：
PackageTool描述：获取关于 cryosparc-tools 的全面信息——CryoSPARC 冷冻电子显微镜处理的接口。
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的关于 cryosparc-tools 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_cryosparc_tools_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_dendropy_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 dendropy 包的信息。Python 包：dendropy
get_dendropy_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_dendropy_info类型：
PackageTool描述：获取有关 dendropy 包的信息。Python 包：dendropy
参数：
无需参数。
示例用法：
query = {
"name": "get_dendropy_info",
"arguments": {
}
}
result = tu.run(query)
**get_ete3_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 ete3 包的信息。Python 包：ete3
get_ete3_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_ete3_info类型：
PackageTool描述：获取有关 ete3 包的信息。Python 包：ete3
参数：
无需参数。
示例用法：
query = {
"name": "get_ete3_info",
"arguments": {
}
}
result = tu.run(query)
**get_fanc_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于FAN-C——核接触分析框架的全面信息
get_fanc_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_fanc_info类型：
PackageTool描述：获取关于FAN-C——用于分析核接触的框架的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的关于FAN-C的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_fanc_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_flask_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 Flask —— 一款轻量级 WSGI Web 应用框架的全面信息
get_flask_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_flask_info类型：
PackageTool描述：获取关于 Flask —— 一款轻量级 WSGI Web 应用框架的全面信息
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_flask_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_flowio_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 FlowIO —— 流式细胞术 FCS 文件输入输出的全面信息
get_flowio_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_flowio_info类型：
PackageTool描述：获取有关 FlowIO —— 流式细胞术的 FCS 文件输入/输出的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的 FlowIO 信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_flowio_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_flowkit_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 FlowKit —— 流式细胞术分析工具包的全面信息
get_flowkit_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_flowkit_info类型：
PackageTool描述：获取关于 FlowKit —— 流式细胞术分析工具包的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填） 要检索的关于 FlowKit 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_flowkit_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_gget_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 gget —— 基因组学命令行工具及 Python 包的全面信息
get_gget_info 工具规范
工具信息：
名称：
get_gget_info类型：
PackageTool描述：获取关于 gget —— 基因组学命令行工具及 Python 包的全面信息
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_gget_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_googlesearch_python_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 googlesearch-python —— 谷歌搜索自动化的全面信息
get_googlesearch_python_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_googlesearch_python_info类型：
PackageTool描述：获取关于 googlesearch-python —— 谷歌搜索自动化的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的关于 googlesearch-python 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_googlesearch_python_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_khmer_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关khmer——核苷酸序列k-mer分析的全面信息
get_khmer_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_khmer_info类型：
PackageTool描述：获取关于khmer——核苷酸序列k-mer分析的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的关于高棉语的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_khmer_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_lifelines_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 lifelines —— Python 生存分析的全面信息
get_lifelines_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_lifelines_info类型：
PackageTool描述：获取关于 lifelines —— Python 中生存分析的全面信息
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_lifelines_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_loompy_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 loompy 的全面信息——高效存储大型组学数据集
get_loompy_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_loompy_info类型：
PackageTool描述：获取关于 loompy 的全面信息——用于大型组学数据集的高效存储方案
参数：
``info_type``（字符串）（必填） 要检索的关于 loompy 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_loompy_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_mageck_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于MAGeCK——CRISPR筛选分析工具包的全面信息
get_mageck_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_mageck_info类型：
PackageTool描述：获取关于MAGeCK——CRISPR筛选分析工具包的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填） 要检索的有关 MAGeCK 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_mageck_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_msprime_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 msprime —— 合并模拟框架的全面信息
get_msprime_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_msprime_info类型：
PackageTool描述：获取关于 msprime —— 共祖模拟框架的全面信息
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_msprime_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_networkx_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 NetworkX —— 网络分析库的全面信息
get_networkx_info 工具规范
工具信息：
名称：
get_networkx_info类型：
PackageTool描述：获取关于 NetworkX —— 网络分析库的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的关于 NetworkX 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_networkx_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_numba_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 Numba —— Python 的即时编译器（JIT 编译器）的全面信息
get_numba_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_numba_info类型：
PackageTool描述：获取关于 Numba —— Python 的即时编译器（JIT 编译器）的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填） 要检索的关于 Numba 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_numba_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_pdbfixer_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 PDBFixer —— 蛋白质结构预处理工具的全面信息
get_pdbfixer_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_pdbfixer_info类型：
PackageTool描述：获取关于PDBFixer——蛋白质结构准备工具的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的有关 PDBFixer 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_pdbfixer_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_plip_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 PLIP —— 蛋白质-配体相互作用分析器的全面信息
get_plip_info 工具规格说明
工具信息：
名称：
get_plip_info类型：
PackageTool描述：获取有关 PLIP（蛋白质-配体相互作用分析器）的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必需）关于 PLIP 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_plip_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_poliastro_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 poliastro——航天动力学库的全面信息
get_poliastro_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_poliastro_info类型：
PackageTool描述：获取有关poliastro——航天动力学库的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的有关poliastro的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_poliastro_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_prody_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关ProDy——蛋白质动力学分析的全面信息
get_prody_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_prody_info类型：
PackageTool描述：获取有关 ProDy（蛋白质动力学分析）的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的关于 ProDy 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_prody_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_pybigwig_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 pyBigWig 的全面信息 – 在 Python 中访问 BigWig 文件
get_pybigwig_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_pybigwig_info类型：
PackageTool描述：获取有关 pyBigWig 的全面信息——在 Python 中访问 BigWig 文件
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的关于 pyBigWig 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_pybigwig_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_pykalman_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 PyKalman 的全面信息——卡尔曼滤波与平滑
get_pykalman_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_pykalman_info类型：
PackageTool描述：获取有关 PyKalman 的全面信息——卡尔曼滤波与平滑
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的有关 PyKalman 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_pykalman_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_pymassspec_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 PyMassSpec 的全面信息——质谱数据分析
get_pymassspec_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_pymassspec_info类型：
PackageTool描述：获取关于 PyMassSpec 的全面信息——质谱数据分析
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的有关 PyMassSpec 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_pymassspec_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_pymed_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 PyMed 的全面信息 – 在 Python 中访问 PubMed
get_pymed_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_pymed_info类型：
PackageTool描述：获取有关 PyMed 的全面信息——在 Python 中访问 PubMed
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_pymed_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_pypdf2_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 PyPDF2——PDF 操作库的全面信息
get_pypdf2_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_pypdf2_info类型：
PackageTool描述：获取有关 PyPDF2——PDF 操作库的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的有关 PyPDF2 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_pypdf2_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_pyscreener_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 PyScreener 的全面信息——基于 Python 的高通量虚拟筛选
get_pyscreener_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_pyscreener_info类型：
PackageTool描述：获取有关 PyScreener 的全面信息——基于 Python 的高通量虚拟筛选
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的有关 PyScreener 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_pyscreener_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_pytdc_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 PyTDC – Therapeutics Data Commons in Python 的全面信息
get_pytdc_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_pytdc_info类型：
PackageTool描述：获取有关 PyTDC – 基于 Python 的治疗数据共享平台的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的有关 PyTDC 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_pytdc_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_requests_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于 Requests 的全面信息 —— 为人类设计的 Python HTTP 库
get_requests_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_requests_info类型：
PackageTool描述：获取关于 Requests 的全面信息——为人类设计的 Python HTTP 库
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_requests_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_ruptures_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于ruptures的全面信息——变点检测库
get_ruptures_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_ruptures_info类型：
PackageTool描述：获取有关 ruptures（变点检测库）的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的断裂相关信息的类型
示例用法：
query = {
"name": "get_ruptures_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_scholarly_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关学术数据的全面信息 – Google Scholar 数据检索
get_scholarly_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_scholarly_info类型：
PackageTool描述：获取有关学术信息的全面数据 —— Google Scholar 数据检索
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的学术信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_scholarly_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_scikit_bio_info**（类型：PackageTool）¶
获取关于scikit-bio的全面信息——这是一个基于科学Python构建的生物信息学库
get_scikit_bio_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_scikit_bio_info类型：
PackageTool描述：获取关于 scikit-bio 的全面信息——一个基于科学 Python 技术栈构建的生物信息学库
参数：
include_examples(boolean) (required) Whether to include usage examples and quick start guide
示例用法：
query = {
"name": "get_scikit_bio_info",
"arguments": {
"include_examples": true
}
}
result = tu.run(query)
**get_trackpy_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 trackpy 的全面信息——适用于 Python 的粒子追踪工具包
get_trackpy_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_trackpy_info类型：
PackageTool描述：获取关于 trackpy 的全面信息——用于 Python 的粒子跟踪工具包
参数：
``info_type``（字符串）（必填）要检索的有关 trackpy 的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_trackpy_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)
**get_tskit_info**（类型：PackageTool）¶
获取有关 tskit——用于群体遗传学的树序列工具包的全面信息
get_tskit_info 工具规范
工具信息：
名称:
get_tskit_info类型：
PackageTool描述：获取有关 tskit（用于群体遗传学的树序列工具包）的全面信息
参数：
``info_type``（字符串）（必填）关于 tskit 要检索的信息类型
示例用法：
query = {
"name": "get_tskit_info",
"arguments": {
"info_type": "example_value"
}
}
result = tu.run(query)