免疫指南工具

配置文件：remote_tools/immune_compass_tools.json 工具类型：远程 工具数量：1

此页面包含在 immune_compass_tools.json 配置文件中定义的所有工具。

可用工具

**run_compass_prediction**（类型：RemoteTool）

使用COMPASS模型预测免疫检查点抑制剂（ICI）反应。该工具分析单细胞数据以评估治疗效果。

run_compass_prediction 工具规范

工具信息：

  • 名称：run_compass_prediction

  • 类型：RemoteTool

  • 描述：使用COMPASS模型预测免疫检查点抑制剂（ICI）的响应情况。本工具通过分析单样本肿瘤基因表达数据，预测患者对免疫检查点抑制剂疗法的反应。COMPASS模型利用免疫细胞概念分析，提供二元预测结果，并提供对驱动预测的免疫微环境因素的可解释性见解。

参数：

  • ``gene_expression_data_path``（字符串）（必填）TPM表达数据文件的路径。键应为标准基因符号（例如：’CD274’、’PDCD1’、’CTLA4’）。值应为以TPM（每百万转录本数）为单位的归一化表达值。建议至少包含约100个基因以确保预测结果的可靠性。

  • threshold (number) (required) Probability threshold for responder classification (0.0-1.0). Values ≥ threshold classify sample as likely responder. Default 0.5 provides balanced sensitivity/specificity. Consider lower thresholds (~0.3) for higher sensitivity.

  • root_path (string) (required) Path to the directory containing model checkpoints. If None, uses COMPASS_MODEL_PATH/immune-compass/checkpoint.

示例用法：

query = {
    "name": "run_compass_prediction",
    "arguments": {
        "gene_expression_data_path": "example_value",
        "threshold": "example_value",
        "root_path": "example_value"
    }
}
result = tu.run(query)