Boltz 工具

配置文件remote_tools/boltz_tools.json 工具类型:远程 工具数量:1

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可用工具

**boltz2_docking**(类型:RemoteTool)

通过 Boltz-2 执行蛋白质-配体对接:输入蛋白质序列及一个或多个配体(SM…

boltz2_docking 工具规格说明

工具信息:

  • 名称boltz2_docking

  • 类型RemoteTool

  • 描述:通过 Boltz-2 执行蛋白质-配体对接:输入一个蛋白质序列以及一个或多个配体(SMILES),即可获得预测结构和置信评分。

参数:

  • ``sequence``(字符串)(必填)目标蛋白的一字母氨基酸序列(FASTA格式,无标题)。

  • ``ligands``(数组)(必需)用于与蛋白质对接的配体定义列表。

  • recycling_steps (integer) (required) Number of recycling steps (overfold iterations).

  • sampling_steps (integer) (required) Number of sampling steps for diffusion process.

  • diffusion_samples (integer) (required) How many diffusion-sampled structures to generate.

  • step_scale (number) (required) Scaling factor for diffusion step size.

  • use_potentials (boolean) (required) If true, omit external force-field potentials from the diffusion process.

  • return_structure (boolean) (required) If false, the predicted structure will not be read or returned. Defaults to false.

示例用法:

query = {
    "name": "boltz2_docking",
    "arguments": {
        "sequence": "example_value",
        "ligands": ["item1", "item2"],
        "recycling_steps": 10,
        "sampling_steps": 10,
        "diffusion_samples": 10,
        "step_scale": "example_value",
        "use_potentials": true,
        "return_structure": true
    }
}
result = tu.run(query)