Boltz 工具¶
配置文件:remote_tools/boltz_tools.json
工具类型:远程
工具数量:1
此页面包含 boltz_tools.json 配置文件中定义的所有工具。
可用工具¶
**boltz2_docking**(类型:RemoteTool)¶
通过 Boltz-2 执行蛋白质-配体对接:输入蛋白质序列及一个或多个配体(SM…
boltz2_docking 工具规格说明
工具信息:
名称:
boltz2_docking类型:
RemoteTool描述:通过 Boltz-2 执行蛋白质-配体对接:输入一个蛋白质序列以及一个或多个配体(SMILES),即可获得预测结构和置信评分。
参数:
``sequence``(字符串)(必填)目标蛋白的一字母氨基酸序列(FASTA格式,无标题)。
``ligands``(数组)(必需)用于与蛋白质对接的配体定义列表。
recycling_steps(integer) (required) Number of recycling steps (overfold iterations).sampling_steps(integer) (required) Number of sampling steps for diffusion process.diffusion_samples(integer) (required) How many diffusion-sampled structures to generate.step_scale(number) (required) Scaling factor for diffusion step size.use_potentials(boolean) (required) If true, omit external force-field potentials from the diffusion process.return_structure(boolean) (required) If false, the predicted structure will not be read or returned. Defaults to false.
示例用法:
query = {
"name": "boltz2_docking",
"arguments": {
"sequence": "example_value",
"ligands": ["item1", "item2"],
"recycling_steps": 10,
"sampling_steps": 10,
"diffusion_samples": 10,
"step_scale": "example_value",
"use_potentials": true,
"return_structure": true
}
}
result = tu.run(query)