tooluniverse.graphql_tool 模块

tooluniverse.graphql_tool.validate_query(query_str, schema_str)

tooluniverse.graphql_tool.remove_none_and_empty_values(json_obj)

删除所有值为 None 或空列表的键值对

tooluniverse.graphql_tool.execute_query(endpoint_url, query, variables=None)

class tooluniverse.graphql_tool.GraphQLTool

基类：BaseTool

__init__(tool_config, endpoint_url)

run(arguments)

执行该工具。

默认的 BaseTool 实现接受一个可选的参数映射，以与大多数具体工具实现保持一致，这些实现通常期望接收一个输入字典。

参数:

• arguments (dict, optional) – 工具专用参数

• stream_callback (callable, optional) – 用于流式响应的回调

• use_cache (bool, optional) – 是否启用了结果缓存

• validate (bool, optional) – 是否已执行参数验证

备注

这些附加参数（stream_callback、use_cache、validate）由 run_one_function() 传递，用于提供有关执行的上下文信息。工具可以利用这些参数进行优化或特殊处理。

为了向后兼容，不接受这些参数的工具仍然可以正常运行——它们只会接收到 arguments 参数。

tooluniverse.graphql_tool._ot_resolve_id(endpoint_url, query_string, entity)

Resolve a gene symbol or disease name to an OpenTargets ID via search.

class tooluniverse.graphql_tool.OpentargetTool

基类：GraphQLTool

__init__(tool_config)

run(arguments)

执行该工具。

默认的 BaseTool 实现接受一个可选的参数映射，以与大多数具体工具实现保持一致，这些实现通常期望接收一个输入字典。

参数:

• arguments (dict, optional) – 工具专用参数

• stream_callback (callable, optional) – 用于流式响应的回调

• use_cache (bool, optional) – 是否启用了结果缓存

• validate (bool, optional) – 是否已执行参数验证

备注

这些附加参数（stream_callback、use_cache、validate）由 run_one_function() 传递，用于提供有关执行的上下文信息。工具可以利用这些参数进行优化或特殊处理。

为了向后兼容，不接受这些参数的工具仍然可以正常运行——它们只会接收到 arguments 参数。

class tooluniverse.graphql_tool.OpentargetToolDrugNameMatch

基类：GraphQLTool

__init__(tool_config, drug_generic_tool=None)

run(arguments)

执行该工具。

默认的 BaseTool 实现接受一个可选的参数映射，以与大多数具体工具实现保持一致，这些实现通常期望接收一个输入字典。

参数:

• arguments (dict, optional) – 工具专用参数

• stream_callback (callable, optional) – 用于流式响应的回调

• use_cache (bool, optional) – 是否启用了结果缓存

• validate (bool, optional) – 是否已执行参数验证

备注

这些附加参数（stream_callback、use_cache、validate）由 run_one_function() 传递，用于提供有关执行的上下文信息。工具可以利用这些参数进行优化或特殊处理。

为了向后兼容，不接受这些参数的工具仍然可以正常运行——它们只会接收到 arguments 参数。

class tooluniverse.graphql_tool.OpentargetGeneticsTool

基类：GraphQLTool

__init__(tool_config)

run(arguments)

执行该工具。

默认的 BaseTool 实现接受一个可选的参数映射，以与大多数具体工具实现保持一致，这些实现通常期望接收一个输入字典。

参数:

• arguments (dict, optional) – 工具专用参数

• stream_callback (callable, optional) – 用于流式响应的回调

• use_cache (bool, optional) – 是否启用了结果缓存

• validate (bool, optional) – 是否已执行参数验证

备注

这些附加参数（stream_callback、use_cache、validate）由 run_one_function() 传递，用于提供有关执行的上下文信息。工具可以利用这些参数进行优化或特殊处理。

为了向后兼容，不接受这些参数的工具仍然可以正常运行——它们只会接收到 arguments 参数。

class tooluniverse.graphql_tool.DiseaseTargetScoreTool

基类：GraphQLTool

用于从特定数据源提取疾病-靶点关联评分的工具

__init__(tool_config, datasource_id=None)

run(arguments)

提取特定数据源的疾病-靶点评分 参数应包含：efoId，datasourceId（可选），pageSize（可选）