tooluniverse.gwas_tool 模块

class tooluniverse.gwas_tool.GWASRESTTool[源代码]

基类:BaseTool

GWAS目录REST API工具的基类。

__init__(tool_config)[源代码]
run(arguments)[源代码]

使用指定参数执行该工具。

class tooluniverse.gwas_tool.GWASAssociationSearch[源代码]

基类:GWASRESTTool

通过多种条件搜索GWAS关联。

__init__(tool_config)[源代码]
run(arguments)[源代码]

使用可选筛选条件搜索关联。

class tooluniverse.gwas_tool.GWASStudySearch[源代码]

基类:GWASRESTTool

按多种条件搜索GWAS研究。

__init__(tool_config)[源代码]
run(arguments)[源代码]

使用可选筛选条件搜索研究。

class tooluniverse.gwas_tool.GWASSNPSearch[源代码]

基类:GWASRESTTool

搜索 GWAS 单核苷酸多态性(SNPs)。

__init__(tool_config)[源代码]
run(arguments)[源代码]

使用可选筛选条件搜索SNP。

class tooluniverse.gwas_tool.GWASAssociationByID[源代码]

基类:GWASRESTTool

根据其ID获取特定的GWAS关联。

__init__(tool_config)[源代码]
run(arguments)[源代码]

通过 ID 获取关联。

class tooluniverse.gwas_tool.GWASStudyByID[源代码]

基类:GWASRESTTool

通过其 ID 获取特定的 GWAS 研究。

__init__(tool_config)[源代码]
run(arguments)[源代码]

通过ID获取研究。

class tooluniverse.gwas_tool.GWASSNPByID[源代码]

基类:GWASRESTTool

通过其 rs ID 获取特定的 GWAS SNP。

__init__(tool_config)[源代码]
run(arguments)[源代码]

通过 rs ID 获取 SNP。

class tooluniverse.gwas_tool.GWASVariantsForTrait[源代码]

基类:GWASRESTTool

获取与特定特征相关的所有变体。

__init__(tool_config)[源代码]
run(arguments)[源代码]

获取具有分页支持的特征变体。

class tooluniverse.gwas_tool.GWASAssociationsForTrait[源代码]

基类:GWASRESTTool

获取特定性状的所有关联,并按p值排序。

__init__(tool_config)[源代码]
run(arguments)[源代码]

获取某个特征的关联,并按重要性排序。

class tooluniverse.gwas_tool.GWASAssociationsForSNP[源代码]

基类:GWASRESTTool

获取特定SNP的所有关联。

__init__(tool_config)[源代码]
run(arguments)[源代码]

获取单核苷酸多态性(SNP)的关联数据。

class tooluniverse.gwas_tool.GWASStudiesForTrait[源代码]

基类:GWASRESTTool

获取特定性状的研究数据,并可选择使用筛选条件。

__init__(tool_config)[源代码]
run(arguments)[源代码]

获取具有可选筛选条件的性状研究。

class tooluniverse.gwas_tool.GWASSNPsForGene[源代码]

基类:GWASRESTTool

获取映射到特定基因的SNPs。

__init__(tool_config)[源代码]
run(arguments)[源代码]

获取基因的SNP信息。

class tooluniverse.gwas_tool.GWASAssociationsForStudy[源代码]

基类:GWASRESTTool

获取特定研究的所有关联。

__init__(tool_config)[源代码]
run(arguments)[源代码]

获取研究的关联信息。