tooluniverse.uniprot_tool 模块

class tooluniverse.uniprot_tool.UniProtRESTTool[源代码]

基类：BaseTool

__init__(tool_config)[源代码]
validate_parameters(arguments)[源代码]

Validate parameters with automatic type coercion for limit.

run(arguments)[源代码]

执行该工具。

默认的 BaseTool 实现接受一个可选的参数映射，以符合大多数具体工具实现对输入字典的预期。

参数:

  • arguments (dict, optional) – 工具专用参数

  • stream_callback (callable, optional) – 用于流式响应的回调

  • use_cache (bool, optional) – 是否启用了结果缓存

  • validate (bool, optional) – 是否已执行参数验证

备注

这些附加参数（stream_callback、use_cache、validate）由 run_one_function() 传递，用于提供有关执行的上下文。工具可以利用这些参数进行优化或特殊处理。

为了向后兼容，不接受这些参数的工具仍然可以正常运行——它们只会接收到 arguments 参数。

get_entry_by_accession(accession)[源代码]
get_function_by_accession(accession)[源代码]
get_names_taxonomy_by_accession(accession)[源代码]
get_subcellular_location_by_accession(accession)[源代码]
get_disease_variants_by_accession(accession)[源代码]
get_ptm_processing_by_accession(accession)[源代码]
get_sequence_isoforms_by_accession(accession)[源代码]