tooluniverse.geo_tool 模块

GEO数据库REST API工具

该工具提供从GEO数据库获取基因表达数据的功能。GEO是一个公共存储库，用于存档并免费分发微阵列、下一代测序以及其他形式的高通量功能基因组学数据。

class tooluniverse.geo_tool.GEORESTTool

基类：NCBIEUtilsTool

GEO Database REST API tool with rate limiting. Generic wrapper for GEO API endpoints defined in expression_tools.json.

__init__(tool_config)

run(arguments)

使用指定的参数执行工具。

class tooluniverse.geo_tool.GEOSearchDatasets

基类：GEORESTTool

Search GEO datasets by various criteria.

__init__(tool_config)

class tooluniverse.geo_tool.GEOGetDatasetInfo

基类：GEORESTTool

Get detailed information about a specific GEO dataset.

__init__(tool_config)

run(arguments)

使用指定的参数执行工具。

class tooluniverse.geo_tool.GEOGetSampleInfo

基类：GEORESTTool

Get sample information for a GEO dataset.

__init__(tool_config)

run(arguments)

使用指定的参数执行工具。