tooluniverse.genomics_gene_search_tool 模块

class tooluniverse.genomics_gene_search_tool.GWASGeneSearch[源代码]

基类:BaseTool

本地工具封装用于GWAS目录REST API。通过基因名称搜索关联。

__init__(tool_config)[源代码]
run(arguments)[源代码]

执行该工具。

默认的 BaseTool 实现接受一个可选的参数映射,以便与大多数具体工具实现对齐,这些工具通常需要一个输入字典。

参数:
  • arguments (dict, optional) – 工具专用参数

  • stream_callback (callable, optional) – 用于流式响应的回调

  • use_cache (bool, optional) – 是否启用了结果缓存

  • validate (bool, optional) – 是否已执行参数验证

备注

这些附加参数(stream_callback、use_cache、validate)由函数 run_one_function() 传递,用于提供执行相关的上下文信息。工具可以利用这些参数进行优化或特殊处理。

为了向后兼容,不接受这些参数的工具仍然可以正常运行——它们只会接收到 arguments 参数。