tooluniverse.compose_scripts 包

子模块

tooluniverse.compose_scripts.biomarker_discovery module

生物标志物发现工作流程 使用组合工具发现并验证特定疾病状态的生物标志物

tooluniverse.compose_scripts.biomarker_discovery.compose(arguments, tooluniverse, call_tool)[源代码]

发现并验证特定疾病状态的生物标志物

tooluniverse.compose_scripts.comprehensive_drug_discovery 模块

综合药物研发流程 完整的端到端药物研发工作流程，从疾病到优化候选药物

tooluniverse.compose_scripts.comprehensive_drug_discovery.compose(arguments, tooluniverse, call_tool)[源代码]

端到端药物研发：靶点 → 先导化合物 → 优化 → 验证

tooluniverse.compose_scripts.drug_safety_analyzer module

药物安全分析流程 综合药物安全分析，结合不良事件数据、文献综述和分子信息

tooluniverse.compose_scripts.drug_safety_analyzer.compose(arguments, tooluniverse, call_tool)[源代码]

DrugSafetyAnalyzer 的主要组成功能

参数:

  • arguments (dict) – 输入参数包括 drug_name、patient_sex、serious_events_only

  • tooluniverse – ToolUniverse 实例

  • call_tool – 调用其他工具的功能

返回

dict: 综合药物安全性分析结果

tooluniverse.compose_scripts.literature_tool module

文献搜索与摘要工具 适用于论文截图的简约编辑工具

tooluniverse.compose_scripts.literature_tool.compose(arguments, tooluniverse, call_tool)[源代码]

搜索文献并生成摘要

tooluniverse.compose_scripts.output_summarizer module

输出摘要编写器脚本

该脚本通过以下方式处理工具输出的智能摘要： 1. 将较大的输出分块为可管理的部分 2. 使用人工智能驱动的摘要功能处理每个分块 3. 将摘要后的分块合并为连贯的最终摘要

脚本利用ToolUniverse的AgenticTool基础架构，提供智能、上下文感知的摘要功能，专注于与原始查询相关的信息。

tooluniverse.compose_scripts.output_summarizer.compose(arguments, tooluniverse, call_tool)[源代码]

主要组成功能用于输出摘要。

此功能协调完整的摘要工作流程： - 将输入文本分割为可管理的片段 - 使用人工智能对每个片段进行摘要 - 将所有摘要合并为最终连贯的结果

参数:

  • arguments (Dict[str, Any]) – 字典包含： - tool_output (str)：需要总结的原始工具输出 - query_context (str)：关于原始查询的上下文信息 - tool_name (str)：生成输出的工具名称 - chunk_size (int, 可选)：处理时每个块的大小 - focus_areas (str, 可选)：总结时需要关注的领域 - max_summary_length (int, 可选)：最终总结的最大长度

  • tooluniverse – ToolUniverse 实例用于工具执行

  • call_tool – 在组合内调用其他工具的功能

返回
Dict[str, Any]：包含以下内容的字典：

  • success (bool)：是否成功完成摘要

  • original_length (int)：原始输出的长度

  • summary_length (int)：最终摘要的长度

  • chunks_processed（整数）：已处理的数据块数量

  • 摘要 (str): 汇总输出

  • tool_name（字符串）：原始工具的名称

  • error（字符串，可选）：如果摘要失败，则显示错误消息

tooluniverse.compose_scripts.tool_description_optimizer module

tooluniverse.compose_scripts.tool_description_optimizer.compose(arguments, tooluniverse, call_tool)[源代码]

tooluniverse.compose_scripts.tool_discover module

tooluniverse.compose_scripts.tool_discover.iterative_comprehensive_optimization(tool_config, call_tool, max_iterations=5, target_score=8.5, temp_dir=None)[源代码]

Comprehensive optimization with guaranteed minimum iterations and multi-agent improvement strategy

tooluniverse.compose_scripts.tool_discover.compose(arguments, tooluniverse, call_tool)[源代码]

通用工具发现与生成系统

tooluniverse.compose_scripts.tool_discover.optimize_code(tool_config, optimization_context, call_tool)[源代码]

Wrapper function that calls the XML-based optimizer

tooluniverse.compose_scripts.tool_graph_composer module

简化并修复了 tool_graph_composer.py。本版本包含更完善的错误处理，并避免了“不可哈希类型”问题。

tooluniverse.compose_scripts.tool_graph_composer.compose(arguments, tooluniverse, call_tool)[源代码]

用于构建工具兼容性图的Compose函数。

参数:

  • arguments – 字典包含构成参数

  • tooluniverse – ToolUniverse 实例

  • call_tool – 调用其他工具的功能

返回

带有结果和文件路径的字典

tooluniverse.compose_scripts.tool_graph_generation module

工具图生成组合脚本

使用单一自主工具高效评估所有提供的工具配置之间的方向性数据流关系。

  • 工具关系检测器

输出一个图结构，其中的边表示有效的方向关系。每条边包含：源节点、目标节点、依据。

性能注意事项：

  • 迭代 i<j 一次（O(N^2/2) 对）。

  • 轻量级 JSON 序列化的最小字段

  • 可选的批处理钩子（当前为顺序执行，因为 call_tool 可能是远程调用）

参数工具配置:

类型 tool_configs:

列表[字典]

参数 max_tools:

类型 max_tools:

int

参数 output_path:

类型 output_path:

str) path to write resulting graph JSON (default './tool_relationship_graph.json'

参数 save_intermediate_every:

类型 save_intermediate_every:

int) 检查点频率（默认处理5000对）

返回:

节点、边、统计

rtype:

带有键的字典

tooluniverse.compose_scripts.tool_graph_generation.compose(arguments, tooluniverse, call_tool)[源代码]

tooluniverse.compose_scripts.tool_metadata_generator module

工具元数据生成管道通过从工具的配置文件中提取详细信息，为工具列表生成全面的元数据

tooluniverse.compose_scripts.tool_metadata_generator.compose(arguments, tooluniverse, call_tool)[源代码]

工具元数据生成的主要组成功能

参数:

  • arguments (dict) – 输入参数包含工具配置JSON列表以及非API工具的tool_type_mappings字典（例如：{‘Databases’: [‘XMLTool’]})

  • tooluniverse – ToolUniverse 实例

  • call_tool – 调用其他工具的功能

返回

列表：工具元数据字典列表（兼容JSON）